Trong đông y, người ta thường tận dụng các bộ phận khác của cây mướp khía để dùng dược liệu như:
- Rễ có công dụng giải độc và thanh nhiệt, dây có tác dụng chỉ khái hóa đàm và thông kinh hoạt lạc.
- Hạt có công dụng sát trùng, nhuận táo, tiêu nhiệt, hóa đàm.
- Lá có tác dụng thanh nhiệt, giải độc và chỉ huyết.
- Xơ mướp còn có thêm tác dụng hoạt huyết, lợi niệu rất tốt.